有很多的窗口管理器， GNOME可以和它们工作的很好。.但有些GNOME的特色(如会话管理， 以及GNOME pager), 并不能和所有的窗口管理器工作. 所以最好使用一个GNOME兼容的窗口管理器. 现在兼容较好的是Enlightenment和IceWM, 其他如FVWM, SCWM, Window Maker 和 QVWM在我们谈论这个问题时正在完善与 GNOME的兼容。